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基本清選是一切種子加工中必要的工序。其目的是清除混入種子中的莖、葉、穗和損傷種子的碎片、雜草種子、泥沙、石塊、空癟等雜物，以提高種子純凈度，并為種子安全干燥和包裝貯藏做好準備。因此主要根據種子大小和密度兩項物理性狀進行分離，有時也根據種子形狀進行分離。
基本清選是采用風篩清選機進行。粗加工的種子進入這種機器后即將種子送入氣流之中，使谷殼等重量輕的物質除去；然后進入頂層篩上剔除大的雜質，進入第二層篩子后將種子按大小分類，第三層篩子對種子進行更細的剔除，最后經過第四層篩子進行種子精細分級，最后種子經過氣流而留下飽滿的種子。適當的篩選和空氣吹揚是獲得滿意結果的重要關鍵。
