孵化廠除了孵化器外，還需要多種配套設備。設備的大小和數量受孵化廠規模大小、孵化器的類型、孵化廠須完成的服務項目等眾多因素的影響。（1）孵化設備孵化器要求溫差小、控溫和控濕精確、孵化效果好、安全可靠、便于操作管理、故障少、便于維修和服務質量好。（2）水處理設備對孵化廠用水需要進行分析，如果水的硬度較大，含泥沙較多，礦物質和泥沙會沉積于濕度控制器及噴嘴處，很快就使其無法運轉。閥門也會因此而關閉不嚴并發生漏水，因此對孵化廠用水必須進行軟化處理和安裝過濾器。（3）種蛋運輸設備為了方便蛋箱、蛋盤和維禽等在廠內的搬運，提高工作效率，孵化廠經常使用各種類型的小車，常用的有四輪車、半升降車、集蛋盤、輸送機等。（4）種蛋分級和洗蛋設備種蛋按大小分級后進行孵化，可以提高孵化效率。大型孵化廠在種蛋入孵前都要按大小進行分級。孵化廠為了提高生產效率，經常使用真空吸蛋器、移蛋器、種蛋分級器、種蛋清洗機等設備。另外，孵化廠還需配備清洗機、雌雄鑒別臺、照蛋器、疫苗注射器等設備。